بررسی بیوانفورماتیکی ژن های خانواده ی عوامل رونویسی wrky در گندم

خانواده ی ژنی wrky رمزکننده گروه بزرگی از عوامل رونویسی هستند که در تنظیم ژن های پاسخ­دهنده به تنش های زیستی و غیرزیستی به خصوص در تنش خشکی دخیل می­باشند؛ برای شناسایی اعضاء این خانواده ژنی در گندم، جستجوی چندگانه در پایگاه های اطلاعاتی مرتبط و tblastn براساس توالی­های حفظ شده ی این خانواده در برنج در داده­های nr، est، htgs انجام شد. توالی­هایی مثل est و cdna (فاقد پروتئین) توسط نرم­افزارهای dnastar و ncbi orf finder ترجمه شدند. هم ردیفی و آنالیز فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزارهای mega4 و bioedit انجام گردید. الگوی بیانی این خانواده­ی ژنی با استفاده از داده­های ریزآرایه و در پایگاه­های plexdb، genevestgator بررسی شد. براساس نتایج به دست آمده، 94 عضو از خانواده­ی ژنی wrky در گندم یافت شد. برای 76 عضو پیدا شده ساختار حفظ شده خانواده wrky به طور کامل وجود داشت و برای دیگر اعضاء توالی کامل پروتئین پیدا نشد. عوامل رونویسی wrky در گندم همانند برنج بر مبنای ساختار دمین حفاظت شده wrky به سه گروه تقسیم شدند. 7 عضو از این خانواده، با توجه به بیان افتراقی آن ها در پاسخ به تنش خشکی در ارقام حساس و متحمل گندم، به عنوان ژن­های منتخب برای افزایش تحمل به خشکی در گندم انتخاب شدند.